Flera vittnen har hört en hög smäll och det har hittats flygplansdelar i bergen, rapporterar tidningen Le Progrès.
Planet försvann vid lunchtid på onsdagen och en större räddningsinsats pågår i trakterna kring orten Mouthe. Helikoptrar som kallats in hindras dock av ett snöoväder som försämrar sikten.