Den uppblossade striden handlar inte om principen att forskningskvalitet ska styra fördelningen. Den gäller i stället sättet som regeringen väljer att värdera forskningskvaliteten och jämförelsen av olika ämnesområden.
Kvalitetssystemet baseras på antal publiceringar och citeringar, samt förmågan att dra in pengar från forskningsråd och näringsliv.